5. EPMO Open Source Coordination Office Redaction File Detail Report

Produced by Araxis Merge on 12/21/2017 6:15:10 PM Eastern Standard Time. See www.araxis.com for information about Merge. This report uses XHTML and CSS2, and is best viewed with a modern standards-compliant browser. For optimum results when printing this report, use landscape orientation and enable printing of background images and colours in your browser.

5.1 Files compared

# Location File Last Modified
1 Thu Dec 21 23:15:10 2017 UTC
2 Genisis_2.0_v7_bld7.zip\Build 7 Genisis2_VIP_Build 7_Version_Description_Document_12152017.docx Thu Dec 21 22:44:32 2017 UTC

5.2 Comparison summary

Description Between
Files 1 and 2
Text Blocks Lines
Unchanged 0 0
Changed 0 0
Inserted 1 375
Removed 0 0

5.3 Comparison options

Whitespace
Character case Differences in character case are significant
Line endings Differences in line endings (CR and LF characters) are ignored
CR/LF characters Not shown in the comparison detail

5.4 Active regular expressions

No regular expressions were active.

5.5 Comparison detail

        1   Version De scription  Document
        2  
        3   Genomic In formation  System for  Integrate d Science  2 (Genisis 2) Technic al Service s
        4   Build 7
        5  
        6  
        7  
        8  
        9  
        10  
        11  
        12  
        13   December 2 017
        14  
        15   Document V ersion 6.0
        16  
        17   Department  of Vetera ns Affairs
        18  
        19   Document R evision Hi story
        20  
        21  
        22   Date
        23   Revision
        24   Descriptio n
        25   Author
        26   02/10/2017
        27   1.0
        28   Build 1 up dates.
        29   Booz Allen  Hamilton
        30   05/12/2017
        31   2.0
        32   Build 2 up dates.
        33   Booz Allen  Hamilton
        34   06/16/2017
        35   3.0
        36   Build 3 up dates.
        37   Booz Allen  Hamilton
        38   09/15/2017
        39   4.0
        40   Build 4 up dates.
        41   Booz Allen  Hamilton
        42   11/03/2017
        43   5.0
        44   Build 5 up dates.
        45   Booz Allen  Hamilton
        46   11/24/2017
        47   6.0
        48   Build 7 up dates.
        49   Booz Allen  Hamilton
        50  
        51  
        52   Deliverabl e (Product ) Version  History
        53  
        54  
        55   Date
        56   Revision
        57   Descriptio n
        58   Project Na me
        59   VA Departm ent
        60   02/2017
        61   Build 1
        62   Enable Res earcher/ D ata Manage r to creat e a reques t for Clin ical, Geno mic or Sur vey Data.
        63   Enable Dat a Managers  to approv e, return,  or reject  Data Requ est with r easons spe cified.
        64   Genomic In formation  System for  Integrate d Science  2 (Genisis 2)
        65   VA ORD (Of fice of Re search and  Developme nt)
        66   05/2017
        67   Build 2
        68   Enable Res earcher /  Data Manag er to add  comments w ith or wit hout advan cing the w orkflow.
        69   Enable Dat a Managers  to copy t ables from  Source to  Destinati on Databas es.
        70   Develop re usable Dat a Operatio ns utiliti es.
        71   Genisis2
        72   VA ORD
        73   06/2017
        74   Build 3
        75   Support fo r two kind s of Data  Managers:  Genisis Da ta Manager  and VINCI  Data Mana ger:
        76   The VINCI  Data Manag er prepare s the data  requested  in one or  more SQL  server tab les and in forms the  Genisis Da ta Manager .
        77   The Genisi s Data Man ager copie s the tabl es over to  a Genisis  Destinati on Databas e. Email n otificatio ns are sen t.
        78   Genisis2
        79   VA ORD
        80  
        81  
        82   Date
        83   Revision
        84   Descriptio n
        85   Project Na me
        86   VA Departm ent
        87   09/2017
        88   Build 4
        89   General Wo rkflow Add itions:
        90   Copy Reque st Functio n – Abilit y to creat e a Draft  Request fr om another  a request  that alre ady exists .
        91   Cancel a R equest.
        92   Ability to  add Comme nts that a re visible  to everyo ne (Genera l Comments ) and only  to manage ment (Oper ational Co mments).
        93   System Adm inistrator  Functions :
        94   Ability to  add users  to the sy stem by sy nchronizin g with the  Genisis2  OpenLDAP d irectory a nd searchi ng for a s pecific us er.
        95   System Adm inistrator  Dashboard  functions : Summary  of Number  of Users b y Role, Re quest Metr ics – Raw  Numbers of  Requests  in Draft,  Approved,  Fulfilled,  etc., and  drilling  down to li st of requ ests of an y one cate gory, down  to the de tails of a ny one req uest.
        96   Genisis2
        97   VA ORD
        98   11/2017
        99   Build 5
        100   Microservi ce APIs –  Support th e TS Progr ammer to d efine 4 mi croservice  APIs to s upport the  Search, C oncept, Bo okmark and  Mapping s ervices.
        101   Cohort Def inition Fu nctions –  Support Re searcher t o (1) sear ch for a c oncept and  view the  search res ults, (2)  Concept Ca rd, (3) bo okmarked a nd un- boo kmark conc epts, and  (4) label  and un-lab el bookmar ked concep ts.
        102   Terminolog y Creating  - Support  Terminolo gist with  Create, Mo dify and D elete func tionalitie s through  CLI.
        103   Genomic In formation  System for  Integrate d Science  2 (Genisis 2) Termino logy Servi ce
        104   VA ORD (Of fice of Re search and  Developme nt)
        105  
        106  
        107   11/2017
        108   Build 7
        109   Cohort Def inition Fu nctions: S upport Res earcher wi th useful  Search Res ults and a  simplifie d Concept  Card for a  Data Elem ent to def ine cohort .
        110   Multiple R oles Conne ction Func tions:  Su pport Rese archer wit h Single S ign- On (S SO), iFram e, Data El ements Int egration,  and Baseli ne Survey  Data Eleme nt List Di splay.
        111   Genomic In formation  System for  Integrate d Science  2 (Genisis 2) Termino logy Servi ce
        112   VA ORD (Of fice of Re search and  Developme nt)
        113  
        114  
        115   Artifact R ationale
        116   VA require s the Vers ion Descri ption Docu ment (VDD)  to identi fy, mainta in, enhanc e, and rec reate the  product (I nformation  Technolog y [IT] ass et) throug hout its l ifecycle.  The VDD re inforces s trong risk  managemen t practice s and help s protect  VA from lo ss of the  product (I T asset),  which is e specially  important  with a reg ular rotat ion of per sonnel and  contracto rs.
        117   The VDD is  a mandate d document  that will  be verifi ed prior t o each rel ease. It i s the auth oritative  inventory  and roadma p of all C onfigurati on Items t hat compri se the dep loyable pr oduct/syst em. Config uration It ems includ e source c ode files,  builds/pa ckages, to ols, basel ines, loca tions, and  associate d product  files. The  VDD is it self a Con figuration  Item main tained und er change  control in  the TRM-a pproved co nfiguratio n manageme nt system,  which is  part of th e VA Feder ated Confi guration M anagement  Data Base  (CMDB).
        118   Project Ma nagers and  Configura tion Manag ers use th e VDD temp late as a  tool for m anaging Co nfiguratio n Items an d baseline s associat ed with th e deployab le product . It is th e responsi bility of  the Projec t Manager  to ensure  the proces ses are fo llowed wit hin the pr oduct buil d process  i.e., ProP ath, Produ ct Build:  BLD-1 Deve lop Produc t Componen t). The ex pectation  is that th e VDD is c ontrolled  just as a  source fil e with hav ing one VD D per Prod uct that h as many ve rsions bei ng managed  within th e Software  Configura tion Manag ement (SCM ) reposito ry followi ng baselin e processe s. The IT  Configurat ion Manage rs (or IT  Architect/ Developmen t Lead) en sure that  creation a nd modific ation of t he Product s VDD is i ntegrated  with any p arallel ac tivities b eing perfo rmed on th e said pro duct. The  Configurat ion Manage r creates/ updates th e VDD each  time the  deliverabl e (file se t) leaves  the develo pment envi ronment, s uch as for  testing o r deployme nt. The VD D is the r epresentat ion and re sult of th e Software  Configura tion Manag ement Proc edures bei ng followe d. The Pro duct Proce dures alon g with wor k instruct ion are to  be create d and main tained by  the IT Con figuration  Managers  (or IT Arc hitect/Dev elopment L ead).  For  product p rocedure i nformation , refer to  the Softw are Config uration Ma nagement P rocedures  Template ( i.e., ProP ath, Proje ct Plannin g: PRP 3.7 ). The Pro ject Manag er is resp onsible fo r ensuring  the Confi guration M anager mai ntains ver sions of t he VDD and  deliverab les (files ) in the T RM- approv ed configu ration man agement sy stem.
        119  
        120   Table of C ontents
        121   Build Desc ription an d Collecti on Informa tion1
        122   General Co nfiguratio n Manageme nt Informa tion1
        123   Configurat ion Manage ment Tools 2
        124   Configurat ion Manage ment of Do cuments2
        125   3.1.  Rati onal Chang e and Conf iguration  Management  (CCM) Doc uments (Fo rmerly RTC )2
        126   Configurat ion Manage ment Devel opment Fil es3
        127   Rational C hange and  Configurat ion Manage ment (CCM)  Repositor y (Formerl y RTC)3
        128   Baseline a nd Compone nt3
        129   Build Info rmation4
        130   CCM/RTC Bu ild Defini tion4
        131   Build Labe l or Numbe r4
        132   Build and  Packaging4
        133   Build Logs 4
        134   Build Syst em/Process  Informati on4
        135   Change Tra cking5
        136   Rational C hange and  Configurat ion Manage ment (CCM)  Repositor y5
        137   Release (D eployment)  Informati on5
        138  
        139   Build Desc ription an d Collecti on Informa tion
        140  
        141   The Versio n Descript ion Docume nt include s informat ion regard ing Genisi s2 Build 5 , which is  a non-pro duction re lease. Gen isis2 Buil d 7 has be en complet ed and is  a Research er ONLY re lease. The  only role  recognize d in Relea se 7 is th e Research er role. T he combina tion of Bu ilds 5 and  7 will be  the third  productio n release,  and will  be named G enisis 2 R elease 4 i n the VA p roduction  environmen t. The URL s for acce ssing the  Build 7 co llections  are as fol lows:
        142   Build 7 Ar tifact (Ra tional ID:  950561)
        143   https://UR L/rm/web#a ction=com. ibm.rdm.we b.pages.sh owArtifact &artifactU R   I=http s%3A%2F%2F UEL%2Frm%2 Fresources %2F_eW2EEs iHEeeiof4j 5X_   HmA& vvc.config uration=ht tps%3A%2F% 2FURL%2Frm %2Fcm%2Fst ream%   2F _j39V1uFIE eWsoNn5L_5 8mg
        144  
        145  
        146   Build 7 Ep ics Collec tion (Rati onal ID: 9 54718)
        147   https://UR L/rm/web#a ction=com. ibm.rdm.we b.pages.sh owArtifact &artifactU R   I=http s%3A%2F%2F URL%2Frm%2 Fresources %2F_pxGYAd YIEeeNjtJW lrv   8Zg& vvc.config uration=ht tps%3A%2F% 2FURL%2Frm %2Fcm%2Fst ream%2   F _j39V1uFIE eWsoNn5L_5 8mg
        148  
        149  
        150  
        151   General Co nfiguratio n Manageme nt Informa tion
        152  
        153  
        154   Deliverabl e (Product ) Name
        155   Configurat ion Manage r
        156   VDD Packag e Name
        157   Project/ D elivery Te am
        158   Genomic In formation  System for  Integrate d Science  2 (Genisis 2)
        159   Brian Fink bohner
        160   Genisis2_V IP_Release  7_Version _Descripti on_Documen t.docx
        161   Sasank Mel anathuru,
        162   Craig Harr is, Michae l Dere, Br enda Delli nger
        163  
        164  
        165  
        166   Configurat ion Manage ment Tools
        167  
        168  
        169   CM Tools
        170   CM Tool Lo cation
        171   Tool Onsit e/ Offsite
        172   CM Tool Ac cess Point  of Contac t
        173   Access Inf ormation ( Forms or o ther Acces s Requirem ents)
        174   Rational T eam Concer t (RTC)
        175   VA network  via CAG a nd Rescue  VPN
        176   Offsite vi a CAG and  Rescue VPN
        177   Rational T ool Team   URL
        178   User accou nt must be  created b y Rational  Tool Team
        179   Rational Q uality Man ager (RQM)
        180   VA network  via CAG a nd Rescue  VPN
        181   Offsite vi a CAG and  Rescue VPN
        182   Rational T ool Team
        183   URL
        184   User accou nt must be  created b y Rational  Tool Team
        185   Rational F unctional  Tester (RF T)
        186   VA network  via CAG a nd Rescue  VPN
        187   Offsite vi a CAG and  Rescue VPN
        188   Rational T ool Team
        189   URL
        190   User accou nt must be  created b y Rational  Tool Team
        191   Rational D OORS
        192   Next Gener ation
        193   VA network  via CAG a nd Rescue  VPN
        194   Offsite vi a CAG and  Rescue VPN
        195   Rational T ool Team
        196   URL
        197   User accou nt must be  created b y Rational  Tool Team
        198  
        199  
        200   Configurat ion Manage ment of Do cuments
        201  
        202   3.1.Ration al Change  and Config uration Ma nagement ( CCM) Docum ents (Form erly RTC)
        203   The CCM/RT C location  for the d ocuments a nd CCM/RTC  explanati on for the  informati on.
        204  
        205   CCM/RTC In formation
        206   Explanatio n
        207   URL
        208   https://UR L/ccm
        209   Project Ar ea
        210   Genisis2 ( CM)
        211   Team Area
        212   NA
        213   Stream
        214   Genisis Do cumentatio n
        215   Baseline I D
        216   Genisis2 R elease 7 D ocumentati on
        217   Component
        218   Documentat ion
        219   Directory  Path
        220   Release Do cumentatio n\Release  7
        221  
        222  
        223   CCM/RTC In formation
        224   Explanatio n
        225   Documents  Included i n the Base line
        226   Integrated  Master Sc hedule (IM S)
        227   Operationa l Acceptan ce Plan (O AP)
        228   Requiremen ts Specifi cation Doc ument (RSD )
        229   Systems De sign docum ent (SDD)
        230   Requiremen ts Traceab ility Matr ix (RTM)
        231   Production  Operation s Manual ( POM)
        232   Backlog/Sp rint/Build  Plans in  Rational
        233   Master Tes t Plan
        234   Master Tes t Plan Che cklist
        235   Test Evalu ation Summ ary
        236   Deployment  Plan, Sch edule and  Checklist
        237   SSP
        238   Installati on Guide
        239   Developers  Guide
        240   Maintenanc e &Trouble shooting G uide
        241   Deployment  Guide
        242   Technical  Manual
        243   ESE Nation al Release  Checklist
        244  
        245  
        246   Configurat ion Manage ment Devel opment Fil es
        247  
        248   Rational C hange and  Configurat ion Manage ment (CCM)  Repositor y (Formerl y RTC)
        249   The CCM/RT C location  for the d evelopment  files (so urce) and  CCM/RTC ex planation  for the in formation.
        250  
        251   CCM/RTC
        252   Informatio n
        253   Explanatio n
        254   CCM URL
        255   https://UR L/ccm
        256   CCM Projec t Area
        257   Genisis (C M)
        258   CCM Team A rea
        259   NA
        260   Stream
        261   Genisis De velopment
        262  
        263   Baseline a nd Compone nt
        264   Where a se t of artif acts are i dentified  as baselin ed, groupe d, and man aged.
        265  
        266   Name
        267   Descriptio n
        268   Developmen t
        269   Component  where sour ce code re sides in C CM
        270   Genisis2 R elease 7 S ource Code
        271   Baseline o f source c ode stream , and its  artifacts,  associate d with Rel ease 5
        272  
        273   Build Info rmation
        274   General bu ild inform ation that  results f rom the bu ild proces s.
        275  
        276   Name
        277   Descriptio n
        278   Build Outp ut
        279   NA
        280   Build Outp ut Directo ry
        281   NA
        282   Target Dep loyment Lo cation
        283   NA
        284  
        285   CCM/RTC Bu ild Defini tion
        286   The name o f the buil d definiti on, which  controls w hat is bui lt and how  it is bui lt.
        287  
        288   Name
        289   Descriptio n
        290   NA
        291   NA
        292  
        293   Build Labe l or Numbe r
        294   The identi fier for t he derived  object or  package t hat was pr oduced for  deploymen t and/or i nstall.
        295  
        296   Name
        297   Descriptio n
        298   NA
        299   NA
        300  
        301  
        302   Build and  Packaging
        303  
        304   Build Logs
        305  
        306  
        307   NA
        308  
        309   Build Syst em/Process  Informati on
        310  
        311  
        312   NA
        313  
        314   Change Tra cking
        315  
        316  
        317   Change Tra cking Tool
        318   Change Tra cking Tool  Location
        319   Tool Onsit e/ Offsite
        320   Change Tra cking Tool  Access/PO C
        321   Access Inf ormation ( Forms or o ther Acces s Requirem ents)
        322   Rational Q uality Man ager (RQM)
        323   VA network  via CAG a nd Rescue  VPN
        324   Offsite vi a CAG and  Rescue VPN
        325   Rational T ool Team U RL
        326   User accou nt must be  created b y Rational  Tool Team
        327   Rational D OORS Next  Generation
        328   VA network  via CAG a nd Rescue  VPN
        329   Offsite vi a CAG and  Rescue VPN
        330   Rational T ool Team U RL
        331   User accou nt must be  created b y Rational  Tool Team
        332  
        333  
        334   Rational C hange and  Configurat ion Manage ment (CCM)  Repositor y
        335  
        336  
        337   Location
        338   Terms
        339   CCM URL
        340   https://UR L/rm
        341   CCM Projec t Area
        342   Genisis2 ( RM)
        343   CCM Team A rea
        344   NA
        345  
        346  
        347   Work Item  ID
        348   Summary
        349   NA
        350   See “Genis is2 Techni cal Servic es Artifac ts, Releas e 7 Collec tion”
        351  
        352  
        353   Release (D eployment)  Informati on
        354  
        355  
        356   Release Id entificati on
        357   Release Pa ckage POC  Name
        358   Release Pa ckage POC  Email
        359   7
        360   PII 
        361   PII
        362   PII
        363   PII
        364  
        365  
        366   Release Pa ckage (Com ponent) Id entified
        367   Release Pa ckage Desc ription
        368   Release Pa ckage Deli very Metho d
        369   Release Pa ckage Loca tion Ident ified
        370   Genisis2-R elease 7.z ip
        371   Zip file c ontaining  all releas e document ation
        372   FTP
        373   The releas e package  is located  in the CC M/RTC repo sitory in  the follow ing locati on:
        374   Project Ar ea = Genis is (CM) St ream = Gen isis Docum entation C omponent =  Documenta tion
        375   Path = Rel ease Docum entation\  Release 7