11. EPMO Open Source Coordination Office Redaction File Detail Report

Produced by Araxis Merge on 12/21/2017 6:15:12 PM Eastern Standard Time. See www.araxis.com for information about Merge. This report uses XHTML and CSS2, and is best viewed with a modern standards-compliant browser. For optimum results when printing this report, use landscape orientation and enable printing of background images and colours in your browser.

11.1 Files compared

# Location File Last Modified
1 Genisis_2.0_v7_bld7.zip\TS\CLI\src\main\java\gov\va\genisis2 TermCli.java Thu Dec 14 19:56:37 2017 UTC
2 Genisis_2.0_v7_bld7.zip\TS\CLI\src\main\java\gov\va\genisis2 TermCli.java Thu Dec 21 21:04:26 2017 UTC

11.2 Comparison summary

Description Between
Files 1 and 2
Text Blocks Lines
Unchanged 2 428
Changed 1 2
Inserted 0 0
Removed 0 0

11.3 Comparison options

Whitespace
Character case Differences in character case are significant
Line endings Differences in line endings (CR and LF characters) are ignored
CR/LF characters Not shown in the comparison detail

11.4 Active regular expressions

No regular expressions were active.

11.5 Comparison detail

  1   package go v.va.genis is2;
  2  
  3   import jav a.io.File;
  4   import jav a.io.FileI nputStream ;
  5   import jav a.io.FileN otFoundExc eption;
  6   import jav a.io.FileO utputStrea m;
  7   import jav a.io.IOExc eption;
  8   import jav a.io.Input Stream;
  9   import jav a.io.Outpu tStream;
  10   import jav a.util.Lis t;
  11   import jav a.util.Pro perties;
  12  
  13   import org .apache.co mmons.cli. CommandLin e;
  14   import org .apache.co mmons.cli. CommandLin eParser;
  15   import org .apache.co mmons.cli. DefaultPar ser;
  16   import org .apache.co mmons.cli. HelpFormat ter;
  17   import org .apache.co mmons.cli. Option;
  18   import org .apache.co mmons.cli. OptionGrou p;
  19   import org .apache.co mmons.cli. Options;
  20   import org .apache.co mmons.cli. ParseExcep tion;
  21   import org .apache.lo g4j.Logger ;
  22  
  23   import com .fasterxml .jackson.c ore.type.T ypeReferen ce;
  24   import com .fasterxml .jackson.d atabind.Ob jectMapper ;
  25  
  26   import gov .va.genisi s2.ts.comm on.dto.Tri pleDTO;
  27   import gov .va.genisi s2.utils.T ermCliCons tants;
  28  
  29   /**
  30    * Command  Line Inte rface Entr y Point
  31    * 
  32    * @author   PII
  33    *
  34    */
  35   public cla ss TermCli  {
  36  
  37           pr ivate stat ic final L ogger LOGG ER = Logge r.getLogge r(TermCli. class);
  38  
  39           pu blic stati c void mai n(String[]  args) {
  40  
  41                    Term CliModel m odel = new  TermCliMo del();
  42  
  43                    Http Client htt pClient =  new HttpCl ient();
  44  
  45                    Comm andLinePar ser parser  = new Def aultParser ();
  46                    Comm andLine cm dLine = nu ll;
  47                    Opti ons option s = null;
  48                    Prop erties pro perties =  new Proper ties();
  49                    Stri ng termSrv iceUrl = n ull;
  50                    
  51                    try  {
  52                             proper ties.load( new FileIn putStream( "cli.prope rties"));
  53                             termSr viceUrl =  properties .getProper ty("term.s ervice.url ");
  54                             
  55                             if (nu ll == term SrviceUrl  || termSrv iceUrl.tri m().length () == 0) {
  56                                      System.e rr.println ("Missing  property f or Termino logy Servi ce URL (te rm.service .url) in c li.propert ies");
  57                                      System.e xit(0);
  58                             }
  59                             
  60                             option s = create CommandLin eOptions() ;
  61                             cmdLin e = parser .parse(opt ions, args );
  62                    } ca tch (Parse Exception  e) {
  63                             LOGGER .error("Co uldn't par se command  line argu ments " +  e);
  64                             System .err.print ln("Error:  " + e);
  65                             HelpFo rmatter fo rmatter =  new HelpFo rmatter();
  66                             format ter.printH elp("java  -jar tsed- jar-with-d ependencie s.jar", op tions);
  67                             System .exit(0);
  68                    } ca tch (FileN otFoundExc eption e)  {
  69                             LOGGER .error("un able to lo cate prope rty file"  + e);
  70                             System .err.print ln("unable  to locate  property  file: cli. properties \n" + e);
  71                             System .exit(0);
  72                    } ca tch (IOExc eption e)  {
  73                             System .err.print ln("Except ion " + e) ;
  74                             e.prin tStackTrac e();
  75                    }
  76                    
  77                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.ADD))  {
  78                             model. setAdd(tru e);
  79                             LOGGER .debug("Ad ding tripl es");
  80                    } el se {
  81                             // be  a drop
  82                             model. setDrop(tr ue);
  83                             LOGGER .debug("Dr opping tri ples");
  84                    }
  85  
  86                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.CHECK _ONLY)) {
  87                             model. setCheckOn ly(true);
  88                             LOGGER .debug("Se tting chec k only mod e true");
  89                    }
  90                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.HELP) ) {
  91                             HelpFo rmatter fo rmatter =  new HelpFo rmatter();
  92                             format ter.printH elp("java  -jar tsed- jar-with-d ependencie s.jar", op tions);
  93                             System .exit(0);
  94                    }
  95                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.VERBO SE)) {
  96                             model. setVerbose (true);
  97                             LOGGER .debug("Se tting chec k only mod e true");
  98                    }
  99                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.IGNOR E_ERR)) {
  100                             model. setIgnoreE rrors(true );
  101                             LOGGER .debug("Se tting no i gnore erro r mode tru e");
  102                    }
  103                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.ALLOW _ERR)) {
  104                             model. setAllowEr rors(true) ;
  105                             LOGGER .debug("Se tting allo w error mo de true");
  106                    }
  107                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.NO_ER R)) {
  108                             model. setNoError s(true);
  109                             LOGGER .debug("Se tting no e rror mode  true");
  110                    }
  111  
  112                    File  input = n ull;
  113                    if ( cmdLine.ha sOption(Te rmCliConst ants.FILE) ) {
  114                             // rea d json fro m file
  115                             input  = new File (cmdLine.g etOptionVa lue(TermCl iConstants .FILE));
  116                    } el se {
  117                             // rea d from sta ndard inpu t
  118                             input  = new File (convertSt dnToFile(S ystem.in)) ;
  119                    }
  120  
  121                    Obje ctMapper m apper = ne w ObjectMa pper();
  122                    List <TripleDTO > triples  = null;
  123  
  124                    try  {
  125                             triple s = mapper .readValue (input, ne w TypeRefe rence<List <TripleDTO >>() {
  126                             });
  127  
  128                    } ca tch (IOExc eption e)  {
  129                             LOGGER .error("Er ror: parsi ng JSON" +  e.getMess age());
  130                             System .err.print ("Error: p arsing JSO N " + e);
  131                    }
  132  
  133                    mode l.setPrope rties(trip les);
  134  
  135                    Syst em.out.pri ntln(model .toJson()) ;
  136                    ////  At this p oint we ha ve the dat a...probab ly should  check for  issues
  137                    ////  here but  now lets t ry to send  the data
  138                    http Client.sen dingUpdate (termSrvic eUrl, mode l.isAdd(),  model.toJ son());
  139  
  140           }
  141  
  142           /* *
  143            *  Create th e option o bjects use d as comma nd line ar guments
  144            *  
  145            *  @return o rg.apache. commons.cl i.Options
  146            * /
  147           pr ivate stat ic Options  createCom mandLineOp tions() {
  148  
  149                    Opti ons option s = new Op tions();
  150  
  151                    Opti on helpOpt ion = Opti on.builder (TermCliCo nstants.HE LP).requir ed(false). desc("Disp lays the h elp messag e").build( );
  152  
  153                    Opti on fileOpt ion = Opti on.builder (TermCliCo nstants.FI LE).number OfArgs(1). required(f alse).desc ("Used to  take in tr iple infor mation fro m a JSON f ormatted f ile").buil d();
  154  
  155                    opti ons.addOpt ion(helpOp tion);
  156                    opti ons.addOpt ion(fileOp tion);
  157  
  158                    // e stablish m utually ex clusive gr oup for re quired add  or drop
  159                    Opti onGroup ad dDropGroup  = new Opt ionGroup() ;
  160                    addD ropGroup.s etRequired (true);
  161  
  162                    Opti on add = O ption.buil der(TermCl iConstants .ADD).desc ("Triples  will be ad ded to Jen a/Fuseki") .build();
  163  
  164                    Opti on drop =  Option.bui lder(TermC liConstant s.DROP).de sc("Triple s will be  deleted fr om Jena/Fu seki").bui ld();
  165  
  166                    addD ropGroup.a ddOption(a dd);
  167                    addD ropGroup.a ddOption(d rop);
  168  
  169                    opti ons.addOpt ionGroup(a ddDropGrou p);
  170  
  171                    // e stablish m utually ex clusive gr oup for er rors
  172                    Opti onGroup er rorGroup =  new Optio nGroup();
  173                    erro rGroup.set Required(t rue);
  174  
  175                    Opti on checkOn lyOption =  Option.bu ilder("c") .longOpt(T ermCliCons tants.CHEC K_ONLY).re quired(fal se).desc(" Checks for  errors bu t performs  no databa se updates ").build() ;
  176  
  177                    Opti on noError Option = O ption.buil der("noErr ").longOpt (TermCliCo nstants.NO _ERR).requ ired(false ).desc("Pe rforms upd ates if an d only if  there are  no errors" ).build();
  178  
  179                    Opti on allowEr rorOption  = Option.b uilder("al lowErr").l ongOpt(Ter mCliConsta nts.ALLOW_ ERR).requi red(false) .desc("Per forms any  and all up dates that  have no e rrors").bu ild();
  180  
  181                    Opti on ignoreE rrorOption  = Option. builder("i gnoreErr") .longOpt(T ermCliCons tants.IGNO RE_ERR).re quired(fal se).desc(" Performs u pdates wit h no discr etion.  De fault mode ").build() ;
  182  
  183                    erro rGroup.add Option(che ckOnlyOpti on);
  184                    erro rGroup.add Option(noE rrorOption );
  185                    erro rGroup.add Option(all owErrorOpt ion);
  186                    erro rGroup.add Option(ign oreErrorOp tion);
  187  
  188                    opti ons.addOpt ionGroup(e rrorGroup) ;
  189  
  190                    retu rn options ;
  191  
  192           }
  193  
  194           pr ivate stat ic String  convertStd nToFile(In putStream  in) {
  195  
  196                    try  (OutputStr eam output Stream = n ew FileOut putStream( new File(T ermCliCons tants.TEMP _INPUT_FIL E))) {
  197                             int re ad = 0;
  198                             byte[]  bytes = n ew byte[10 24];
  199  
  200                             while  ((read = i n.read(byt es)) != -1 ) {
  201                                      outputSt ream.write (bytes, 0,  read);
  202                             }
  203                    } ca tch (IOExc eption e)  {
  204                             LOGGER .error("Er ror conver ting stdin  to file:  " + e.getM essage());
  205                    } fi nally {
  206                             if (in  != null)
  207                                      try {
  208                                               in.close() ;
  209                                      } catch  (IOExcepti on e) {
  210                                               LOGGER.err or("Error  couldn't c lose file:  " + e.get Message()) ;
  211                                      }
  212                    }
  213                    retu rn TermCli Constants. TEMP_INPUT _FILE;
  214           }
  215   }

Araxis Merge (but not the data content of this report) is Copyright © 1993-2016 Araxis Ltd (www.araxis.com). All rights reserved.