426. EPMO Open Source Coordination Office Redaction File Detail Report

Produced by Araxis Merge on 12/5/2017 12:06:51 PM Central Standard Time. See www.araxis.com for information about Merge. This report uses XHTML and CSS2, and is best viewed with a modern standards-compliant browser. For optimum results when printing this report, use landscape orientation and enable printing of background images and colours in your browser.

426.1 Files compared

# Location File Last Modified
1 IV-eHMP_CIF.zip\IMAG_Source\VISA\Java\VixVistaImagingDataSourceProvider\main\src\java\gov\va\med\imaging\vistaimagingdatasource\vix VistaImagingImageAnnotationDataSourceService.java Mon Dec 4 21:35:06 2017 UTC
2 IV-eHMP_CIF.zip\IMAG_Source\VISA\Java\VixVistaImagingDataSourceProvider\main\src\java\gov\va\med\imaging\vistaimagingdatasource\vix VistaImagingImageAnnotationDataSourceService.java Mon Dec 4 22:07:40 2017 UTC

426.2 Comparison summary

Description Between
Files 1 and 2
Text Blocks Lines
Unchanged 3 650
Changed 2 4
Inserted 0 0
Removed 0 0

426.3 Comparison options

Whitespace
Character case Differences in character case are significant
Line endings Differences in line endings (CR and LF characters) are ignored
CR/LF characters Not shown in the comparison detail

426.4 Active regular expressions

No regular expressions were active.

426.5 Comparison detail

  1   /**
  2    * 
  3     Package:  MAG - Vis tA Imaging
  4     WARNING:  Per VHA D irective 2 004-038, t his routin e should n ot be modi fied.
  5     Date Cre ated: Jun  17, 2011
  6     Site Nam e:  Washin gton OI Fi eld Office , Silver S pring, MD
  7       Developer:          
WERFEJ
  8     Descript ion: 
  9  
  10           ;;  +-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- +
  11           ;;  Property  of the US  Government .
  12           ;;  No permis sion to co py or redi stribute t his softwa re is give n.
  13           ;;  Use of un released v ersions of  this soft ware requi res the us er
  14           ;;   to execu te a writt en test ag reement wi th the Vis tA Imaging
  15           ;;   Developm ent Office  of the De partment o f Veterans  Affairs,
  16           ;;   telephon e (301) 73 4-0100.
  17           ;;
  18           ;;  The Food  and Drug A dministrat ion classi fies this  software a s
  19           ;;  a Class I I medical  device.  A s such, it  may not b e changed
  20           ;;  in any wa y.  Modifi cations to  this soft ware may r esult in a n
  21           ;;  adulterat ed medical  device un der 21CFR8 20, the us e of which
  22           ;;  is consid ered to be  a violati on of US F ederal Sta tutes.
  23           ;;  +-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- +
  24  
  25    */
  26   package go v.va.med.i maging.vis taimagingd atasource. vix;
  27  
  28   import jav a.io.IOExc eption;
  29   import jav a.util.Lis t;
  30  
  31   import org .apache.lo gging.log4 j.LogManag er;
  32   import org .apache.lo gging.log4 j.Logger;
  33  
  34   import gov .va.med.im aging.Abst ractImagin gURN;
  35   import gov .va.med.im aging.Imag eAnnotatio nURN;
  36   import gov .va.med.im aging.arti factsource .ResolvedA rtifactSou rce;
  37   import gov .va.med.im aging.core .interface s.exceptio ns.Connect ionExcepti on;
  38   import gov .va.med.im aging.core .interface s.exceptio ns.MethodE xception;
  39   import gov .va.med.im aging.core .interface s.exceptio ns.Securit yCredentia lsExpiredE xception;
  40   import gov .va.med.im aging.data source.Ima geAnnotati onDataSour ceSpi;
  41   import gov .va.med.im aging.data source.exc eptions.In validCrede ntialsExce ption;
  42   import gov .va.med.im aging.data source.exc eptions.Un supportedP rotocolExc eption;
  43   import gov .va.med.im aging.exch ange.busin ess.Resolv edSite;
  44   import gov .va.med.im aging.exch ange.busin ess.Site;
  45   import gov .va.med.im aging.exch ange.busin ess.annota tions.Imag eAnnotatio n;
  46   import gov .va.med.im aging.exch ange.busin ess.annota tions.Imag eAnnotatio nDetails;
  47   import gov .va.med.im aging.exch ange.busin ess.annota tions.Imag eAnnotatio nSource;
  48   import gov .va.med.im aging.tran sactioncon text.Trans actionCont extFactory ;
  49   import gov .va.med.im aging.url. vista.Vist aQuery;
  50   import gov .va.med.im aging.url. vista.exce ptions.Inv alidVistaC redentials Exception;
  51   import gov .va.med.im aging.url. vista.exce ptions.Vis taMethodEx ception;
  52   import gov .va.med.im aging.vist adatasourc e.common.V istaCommon Utilities;
  53   import gov .va.med.im aging.vist adatasourc e.session. VistaSessi on;
  54   import gov .va.med.im aging.vist aimagingda tasource.A bstractVis taImagingD ataSourceS ervice;
  55   import gov .va.med.im aging.vist aimagingda tasource.c ommon.Vist aImagingCo mmonUtilit ies;
  56   import gov .va.med.im aging.vist aimagingda tasource.v ix.query.V istaImagin gVixQueryF actory;
  57   import gov .va.med.im aging.vist aimagingda tasource.v ix.transla tor.VistaI magingVixT ranslator;
  58  
  59   /**
  60    * @author         
WERFEJ
  61    *
  62    */
  63   public cla ss VistaIm agingImage Annotation DataSource Service
  64   extends Ab stractVist aImagingDa taSourceSe rvice
  65   implements  ImageAnno tationData SourceSpi
  66   {
  67           
  68           pr ivate Logg er logger  = LogManag er.getLogg er(this.ge tClass());
  69           
  70           pu blic final  static St ring SUPPO RTED_PROTO COL = "vis taimaging" ;
  71           
  72           //  The requi red versio n of VistA  Imaging n eeded to e xecute the  RPC calls  for this  operation
  73           pu blic final  static St ring MAG_R EQUIRED_VE RSION = "3 .0P122"; 
  74  
  75           /* *
  76            *  @param re solvedArti factSource
  77            *  @param pr otocol
  78            * /
  79           pu blic Vista ImagingIma geAnnotati onDataSour ceService( ResolvedAr tifactSour ce resolve dArtifactS ource, 
  80                             String  protocol)
  81           {
  82                    supe r(resolved ArtifactSo urce, prot ocol);
  83                    if(!  (resolved ArtifactSo urce insta nceof Reso lvedSite)  )
  84                             throw  new Unsupp ortedOpera tionExcept ion("The a rtifact so urce must  be an inst ance of Re solvedSite  and it is  a '" + re solvedArti factSource .getClass( ).getSimpl eName() +  "'.");
  85           }
  86  
  87           pu blic stati c VistaIma gingImageA nnotationD ataSourceS ervice cre ate(Resolv edArtifact Source res olvedArtif actSource,  String pr otocol)
  88           th rows Conne ctionExcep tion, Unsu pportedPro tocolExcep tion
  89           {
  90                    retu rn new Vis taImagingI mageAnnota tionDataSo urceServic e(resolved ArtifactSo urce, prot ocol);
  91           }
  92           
  93           /* *
  94            *  The artif act source  must be c hecked in  the constr uctor to a ssure that  it is an  instance
  95            *  of Resolv edSite.
  96            *  
  97            *  @return
  98            * /
  99           pr otected Re solvedSite  getResolv edSite()
  100           {
  101                    retu rn (Resolv edSite)get ResolvedAr tifactSour ce();
  102           }
  103           
  104           pr otected Si te getSite ()
  105           {
  106                    retu rn getReso lvedSite() .getSite() ;
  107           }
  108           
  109           pr ivate Vist aSession g etVistaSes sion() 
  110       throws  IOExcepti on, Connec tionExcept ion, Metho dException
  111       {
  112                return V istaSessio n.getOrCre ate(getMet adataUrl() , getSite( ));
  113       }
  114           
  115           /*  (non-Java doc)
  116            *  @see gov. va.med.ima ging.datas ource.Imag ingPatient DataSource #isVersion Compatible ()
  117            * /
  118           @O verride
  119           pu blic boole an isVersi onCompatib le() 
  120           th rows Secur ityCredent ialsExpire dException
  121           {
  122                    Stri ng version  = VistaIm agingCommo nUtilities .getVistaD ataSourceI magingVers ion(
  123                                      getVista ImagingCon figuration (), this.g etClass(),  
  124                                      MAG_REQU IRED_VERSI ON);
  125                    
  126                    logg er.info("i sVersionCo mpatible s earching f or version  [" + vers ion + "],  Transactio nContext ( " + Transa ctionConte xtFactory. get().getD isplayIden tity() + " ).");
  127                    Vist aSession l ocalVistaS ession = n ull;
  128                    try
  129                    {
  130                             localV istaSessio n = getVis taSession( );  
  131                             return  VistaImag ingCommonU tilities.i sVersionCo mpatible(v ersion, lo calVistaSe ssion);      
  132                    }
  133                    catc h(Security Credential sExpiredEx ception sc eX)
  134                    {
  135                             // cau ght here t o be sure  it gets th rown as Se curityCred entialsExp iredExcept ion, not C onnectionE xception
  136                             throw  sceX;
  137                    }
  138                    catc h(MethodEx ception mX )
  139                    {
  140                             logger .error("Th ere was an  error fin ding the i nstalled I maging ver sion from  VistA", mX );
  141                             Transa ctionConte xtFactory. get().addD ebugInform ation("isV ersionComp atible() f ailed, " +  (mX == nu ll ? "<nul l error>"  : mX.getMe ssage()));
  142                    }
  143                    catc h(Connecti onExceptio n cX)
  144                    {
  145                             logger .error("Th ere was an  error fin ding the i nstalled I maging ver sion from  VistA", cX );
  146                             Transa ctionConte xtFactory. get().addD ebugInform ation("isV ersionComp atible() f ailed, " +  (cX == nu ll ? "<nul l error>"  : cX.getMe ssage()));
  147                    }                 
  148                    catc h(IOExcept ion ioX)
  149                    {
  150                             logger .error("Th ere was an  error fin ding the i nstalled I maging ver sion from  VistA", io X);
  151                             Transa ctionConte xtFactory. get().addD ebugInform ation("isV ersionComp atible() f ailed, " +  (ioX == n ull ? "<nu ll error>"  : ioX.get Message()) );
  152                    }
  153                    fina lly
  154                    {
  155                             try{lo calVistaSe ssion.clos e();}
  156                             catch( Throwable  t){}
  157                    }                 
  158                    retu rn false;
  159           }
  160           
  161           pr otected St ring getDa taSourceVe rsion()
  162           {
  163                    retu rn "1";
  164           }
  165  
  166           @O verride
  167           pu blic List< ImageAnnot ation> get ImageAnnot ations(Abs tractImagi ngURN imag ingUrn)
  168           th rows Metho dException , Connecti onExceptio n
  169           {
  170                    Vist aCommonUti lities.set DataSource MethodAndV ersion("ge tImageAnno tations",  getDataSou rceVersion ());
  171                    logg er.info("g etImageAnn otations ( " + imagin gUrn.toStr ing() + ")  Transacti onContext  (" + Trans actionCont extFactory .get().get DisplayIde ntity() +  ").");
  172                    Vist aSession l ocalVistaS ession = n ull;
  173                    try 
  174                    {
  175                             localV istaSessio n = getVis taSession( );
  176                             VistaQ uery query  = 
  177                                      VistaIma gingVixQue ryFactory. createGetI mageAnnota tionsQuery (imagingUr n.getImagi ngIdentifi er());
  178                             String  rtn = loc alVistaSes sion.call( query);
  179                             //Syst em.out.pri ntln("RTN:  " + rtn);
  180                             return  VistaImag ingVixTran slator.tra nslateImag eAnnotatio ns(imaging Urn, rtn);
  181                    }
  182                    catc h(IOExcept ion ioX)
  183                    {
  184                             logger .error("Ex ception ge tting Vist A session" , ioX);
  185                    thro w new Conn ectionExce ption(ioX) ;
  186                    }
  187                    catc h (Invalid VistaCrede ntialsExce ption e)
  188                    {
  189                             throw  new Invali dCredentia lsExceptio n(e.getMes sage());
  190                    }
  191                    catc h (VistaMe thodExcept ion e)
  192                    {
  193                             throw  new Method Exception( e.getMessa ge());
  194                    }
  195                    fina lly
  196           {
  197                    try{ localVista Session.cl ose();}cat ch(Throwab le t){}
  198           }
  199           }
  200  
  201           @O verride
  202           pu blic Image Annotation Details ge tAnnotatio nDetails(
  203                             Abstra ctImagingU RN imaging Urn,
  204                             ImageA nnotationU RN imageAn notationUr n) 
  205           th rows Metho dException , Connecti onExceptio n
  206           {
  207                    Vist aCommonUti lities.set DataSource MethodAndV ersion("ge tAnnotatio nDetails",  getDataSo urceVersio n());
  208                    logg er.info("g etAnnotati onDetails  (" + imagi ngUrn.toSt ring() + " ), (" + im ageAnnotat ionUrn.toS tring() +  ") Transac tionContex t (" + Tra nsactionCo ntextFacto ry.get().g etDisplayI dentity()  + ").");
  209                    Vist aSession l ocalVistaS ession = n ull;
  210                    try 
  211                    {
  212                             localV istaSessio n = getVis taSession( );
  213                             return  getAnnota tionDetail sInternal( localVista Session, i magingUrn,  imageAnno tationUrn) ;
  214                    }
  215                    catc h(IOExcept ion ioX)
  216                    {
  217                             logger .error("Ex ception ge tting Vist A session" , ioX);
  218                    thro w new Conn ectionExce ption(ioX) ;
  219                    }
  220                    catc h (Invalid VistaCrede ntialsExce ption e)
  221                    {
  222                             throw  new Invali dCredentia lsExceptio n(e.getMes sage());
  223                    }
  224                    catc h (VistaMe thodExcept ion e)
  225                    {
  226                             throw  new Method Exception( e.getMessa ge());
  227                    }
  228                    fina lly
  229           {
  230                    try{ localVista Session.cl ose();}cat ch(Throwab le t){}
  231           }
  232           }
  233           
  234           pr ivate Imag eAnnotatio nDetails g etAnnotati onDetailsI nternal(Vi staSession  localVist aSession,
  235                             Abstra ctImagingU RN imaging Urn, Image Annotation URN imageA nnotationU rn) 
  236           th rows IOExc eption, In validVista Credential sException , VistaMet hodExcepti on, Method Exception
  237           {
  238                    Vist aQuery que ry = 
  239                             VistaI magingVixQ ueryFactor y.createGe tImageAnno tationDeta ilsQuery(
  240                                               imagingUrn .getImagin gIdentifie r(),
  241                                               imageAnnot ationUrn.g etAnnotati onId());
  242                    Stri ng rtn = l ocalVistaS ession.cal l(query);
  243                    //Sy stem.out.p rintln("Rt n: " + rtn );
  244                    retu rn VistaIm agingVixTr anslator.t ranslateIm ageAnnotat ionDetails (imagingUr n, 
  245                                      imageAnn otationUrn , rtn);
  246           }
  247  
  248           @O verride
  249           pu blic Image Annotation  storeImag eAnnotatio nDetails(A bstractIma gingURN im agingUrn,
  250                             String  annotatio nDetails,  String ann otationVer sion, Imag eAnnotatio nSource an notationSo urce)
  251           th rows Metho dException , Connecti onExceptio n
  252           {
  253                    Vist aCommonUti lities.set DataSource MethodAndV ersion("st oreImageAn notationDe tails", ge tDataSourc eVersion() );
  254                    logg er.info("s toreImageA nnotationD etails ("  + imagingU rn.toStrin g() + ") T ransaction Context ("  + Transac tionContex tFactory.g et().getDi splayIdent ity() + ") .");
  255                    Vist aSession l ocalVistaS ession = n ull;
  256                    try 
  257                    {
  258                             localV istaSessio n = getVis taSession( );
  259                             VistaQ uery query  = 
  260                                      VistaIma gingVixQue ryFactory. createStor eImageAnno tationDeta ilsQuery(i magingUrn. getImaging Identifier (), 
  261                                                       an notationDe tails, ann otationVer sion, anno tationSour ce);
  262                             String  rtn = loc alVistaSes sion.call( query);
  263                             //Syst em.out.pri ntln("Rtn  is: " + rt n);
  264                             return  VistaImag ingVixTran slator.tra nslateStor eImageAnno tationResu lt(imaging Urn, rtn.t rim());
  265                    }
  266                    catc h(IOExcept ion ioX)
  267                    {
  268                             logger .error("Ex ception ge tting Vist A session" , ioX);
  269                    thro w new Conn ectionExce ption(ioX) ;
  270                    }
  271                    catc h (Invalid VistaCrede ntialsExce ption e)
  272                    {
  273                             throw  new Invali dCredentia lsExceptio n(e.getMes sage());
  274                    }
  275                    catc h (VistaMe thodExcept ion e)
  276                    {
  277                             throw  new Method Exception( e.getMessa ge());
  278                    }
  279                    fina lly
  280           {
  281                    try{ localVista Session.cl ose();}cat ch(Throwab le t){}
  282           }
  283           }
  284  
  285           @O verride
  286           pu blic Image Annotation Details ge tMostRecen tAnnotatio nDetails(
  287                             Abstra ctImagingU RN imaging Urn) 
  288           th rows Metho dException , Connecti onExceptio n
  289           {
  290                    Vist aCommonUti lities.set DataSource MethodAndV ersion("ge tMostRecen tAnnotatio nDetails",  getDataSo urceVersio n());
  291                    logg er.info("g etMostRece ntAnnotati onDetails  (" + imagi ngUrn.toSt ring() + " ) Transact ionContext  (" + Tran sactionCon textFactor y.get().ge tDisplayId entity() +  ").");
  292                    Vist aSession l ocalVistaS ession = n ull;
  293                    try 
  294                    {
  295                             localV istaSessio n = getVis taSession( );
  296                             VistaQ uery query  = 
  297                                      VistaIma gingVixQue ryFactory. createGetI mageAnnota tionsQuery (imagingUr n.getImagi ngIdentifi er());
  298                             String  rtn = loc alVistaSes sion.call( query);
  299                             List<I mageAnnota tion> imag eAnnotatio ns = Vista ImagingVix Translator .translate ImageAnnot ations(ima gingUrn, r tn);
  300                             if(ima geAnnotati ons == nul l || image Annotation s.size() < = 0)
  301                                      return n ull;
  302                             
  303                             // get  the last  item in th e list (th e newest a nnotation  layer)
  304                             ImageA nnotation  mostRecent Annotation Layer = im ageAnnotat ions.get(i mageAnnota tions.size () - 1);
  305                             logger .info("Ret rieving an notation l ayer '" +  mostRecent Annotation Layer.getA nnotationU rn().toStr ing() + "' .");
  306                    
  307                             return  getAnnota tionDetail sInternal( localVista Session, i magingUrn,  mostRecen tAnnotatio nLayer.get Annotation Urn());
  308                    }
  309                    catc h(IOExcept ion ioX)
  310                    {
  311                             logger .error("Ex ception ge tting Vist A session" , ioX);
  312                    thro w new Conn ectionExce ption(ioX) ;
  313                    }
  314                    catc h (Invalid VistaCrede ntialsExce ption e)
  315                    {
  316                             throw  new Invali dCredentia lsExceptio n(e.getMes sage());
  317                    }
  318                    catc h (VistaMe thodExcept ion e)
  319                    {
  320                             throw  new Method Exception( e.getMessa ge());
  321                    }
  322                    fina lly
  323           {
  324                    try{ localVista Session.cl ose();}cat ch(Throwab le t){}
  325           }
  326           }
  327   }

Araxis Merge (but not the data content of this report) is Copyright © 1993-2016 Araxis Ltd (www.araxis.com). All rights reserved.