345. EPMO Open Source Coordination Office Redaction File Detail Report

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345.1 Files compared

# Location File Last Modified
1 IV-eHMP_CIF.zip\IMAG_Source\VISA\Java\ROICommands\main\src\java\gov\va\med\imaging\roi\cache ROIVASourcedCacheDecorator.java Mon Dec 4 21:35:04 2017 UTC
2 IV-eHMP_CIF.zip\IMAG_Source\VISA\Java\ROICommands\main\src\java\gov\va\med\imaging\roi\cache ROIVASourcedCacheDecorator.java Mon Dec 4 22:05:20 2017 UTC

345.2 Comparison summary

Description Between
Files 1 and 2
Text Blocks Lines
Unchanged 3 390
Changed 2 4
Inserted 0 0
Removed 0 0

345.3 Comparison options

Whitespace
Character case Differences in character case are significant
Line endings Differences in line endings (CR and LF characters) are ignored
CR/LF characters Not shown in the comparison detail

345.4 Active regular expressions

No regular expressions were active.

345.5 Comparison detail

  1   /**
  2    * 
  3     Package:  MAG - Vis tA Imaging
  4     WARNING:  Per VHA D irective 2 004-038, t his routin e should n ot be modi fied.
  5     Date Cre ated: Apr  9, 2012
  6     Site Nam e:  Washin gton OI Fi eld Office , Silver S pring, MD
  7       Developer:          
WERFEJ
  8     Descript ion: 
  9  
  10           ;;  +-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- +
  11           ;;  Property  of the US  Government .
  12           ;;  No permis sion to co py or redi stribute t his softwa re is give n.
  13           ;;  Use of un released v ersions of  this soft ware requi res the us er
  14           ;;   to execu te a writt en test ag reement wi th the Vis tA Imaging
  15           ;;   Developm ent Office  of the De partment o f Veterans  Affairs,
  16           ;;   telephon e (301) 73 4-0100.
  17           ;;
  18           ;;  The Food  and Drug A dministrat ion classi fies this  software a s
  19           ;;  a Class I I medical  device.  A s such, it  may not b e changed
  20           ;;  in any wa y.  Modifi cations to  this soft ware may r esult in a n
  21           ;;  adulterat ed medical  device un der 21CFR8 20, the us e of which
  22           ;;  is consid ered to be  a violati on of US F ederal Sta tutes.
  23           ;;  +-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- +
  24  
  25    */
  26   package go v.va.med.i maging.roi .cache;
  27  
  28   import jav a.io.IOExc eption;
  29   import jav a.io.Objec tInputStre am;
  30   import jav a.io.Objec tOutputStr eam;
  31   import jav a.nio.chan nels.Chann els;
  32   import jav a.nio.chan nels.Reada bleByteCha nnel;
  33   import jav a.nio.chan nels.Writa bleByteCha nnel;
  34  
  35   import org .apache.lo gging.log4 j.LogManag er;
  36   import org .apache.lo gging.log4 j.Logger;
  37  
  38   import gov .va.med.Pa tientIdent ifier;
  39   import gov .va.med.im aging.exch ange.stora ge.cache.V ASourcedCa che;
  40   import gov .va.med.im aging.exch ange.stora ge.cache.V ASourcedCa cheDecorat or;
  41   import gov .va.med.im aging.roi. ROIStudyLi st;
  42   import gov .va.med.im aging.stor age.cache. Cache;
  43   import gov .va.med.im aging.stor age.cache. Instance;
  44   import gov .va.med.im aging.stor age.cache. exceptions .CacheExce ption;
  45  
  46   /**
  47    * @author         
WERFEJ
  48    *
  49    */
  50   public cla ss ROIVASo urcedCache Decorator 
  51   extends VA SourcedCac heDecorato r
  52   implements  ROIVASour cedCache
  53   {
  54           pr ivate stat ic ROIVASo urcedCache  roiVaSour cedCache =  null;
  55           pr ivate fina l static L ogger logg er = LogMa nager.getL ogger(ROIV ASourcedCa cheDecorat or.class);
  56           
  57           pu blic synch ronized st atic ROIVA SourcedCac he getInst ance(VASou rcedCache  vaSourcedC ache)
  58           {
  59                    if(r oiVaSource dCache ==  null)
  60                    {
  61                             roiVaS ourcedCach e = new RO IVASourced CacheDecor ator(vaSou rcedCache. getWrapped Cache(), 
  62                                               vaSourcedC ache.getMe tadataRegi onName(),  vaSourcedC ache.getIm ageRegionN ame());
  63                    }
  64                    retu rn roiVaSo urcedCache ;
  65           }
  66                    
  67           pr ivate ROIV ASourcedCa cheDecorat or(Cache w rappedCach e,
  68                             String  metadataR egionName,  
  69                             String  imageRegi onName)
  70           {
  71                    supe r(wrappedC ache, meta dataRegion Name, imag eRegionNam e);
  72           }
  73  
  74           /*  (non-Java doc)
  75            *  @see gov. va.med.ima ging.roi.c ache.ROIVA SourcedCac he#getROIR equest(gov .va.med.im aging.GUID )
  76            * /
  77           @O verride
  78           pu blic ROISt udyList ge tROIStudyL ist(Patien tIdentifie r patientI dentifier,  String gu id) 
  79           th rows Cache Exception
  80           {
  81                    Stri ng[] group s = create ROIRequest GroupName( patientIde ntifier);
  82                    Stri ng groupKe y = create ROIRequest Key(guid);
  83                    
  84                    retu rn getMeta dataFromIm ageRegion( ROIStudyLi st.class,  groups, gr oupKey);
  85           }
  86  
  87           /*  (non-Java doc)
  88            *  @see gov. va.med.ima ging.roi.c ache.ROIVA SourcedCac he#createR OIRequest( gov.va.med .imaging.r oi.ROIRequ est)
  89            * /
  90           @O verride
  91           pu blic void  createROIS tudyList(P atientIden tifier pat ientIdenti fier, Stri ng guid, 
  92                             ROIStu dyList roi StudyList)  
  93           th rows Cache Exception
  94           {
  95                    Stri ng[] group s = create ROIRequest GroupName( patientIde ntifier);
  96                    Stri ng groupKe y = create ROIRequest Key(guid);
  97                    
  98                    crea teMetadata InImageReg ion(groups , groupKey , roiStudy List);
  99           }
  100           
  101           pr otected <T > void cre ateMetadat aInImageRe gion(
  102                             String [] groups,  
  103                             String  groupKey,  
  104                             T meta data) 
  105                    thro ws CacheEx ception
  106                    {
  107                             Writab leByteChan nel metada taWritable  = null;
  108                             Object OutputStre am metadat aOutStream  = null;
  109                             try
  110                             {
  111                                      if( getW rappedCach e().isEnab led().bool eanValue()  )
  112                                      {
  113                                               Instance m etadataIns tance = ge tWrappedCa che().getO rCreateIns tance(
  114                                                                getI mageRegion Name(), 
  115                                                                grou ps, 
  116                                                                grou pKey);
  117                                               if(metadat aInstance  != null)
  118                                               {
  119                                                       me tadataWrit able = met adataInsta nce.getWri tableChann el();
  120                                                       me tadataOutS tream = ne w ObjectOu tputStream (Channels. newOutputS tream(meta dataWritab le));
  121                                                       
  122                                                       me tadataOutS tream.writ eObject(me tadata);
  123                                               }
  124                                               else
  125                                                       lo gger.warn( "Unable to  write to  cache and  cache is e nabled.  A pplication  will cont inue to op erate with  reduced p erformance .");
  126                                      }
  127                             } 
  128                             catch  (IOExcepti on e)
  129                             {
  130                                      e.printS tackTrace( );
  131                             }
  132                             finall y
  133                             {
  134                                      try{if(m etadataOut Stream !=  null) meta dataOutStr eam.close( );}
  135                                      catch(Th rowable t) {}
  136                             }
  137                             
  138                             return ;
  139                    }
  140           
  141           pr otected <T > T getMet adataFromI mageRegion (Class<T>  expectedRe sultClass,  String[]  groups, St ring group Key) 
  142           th rows Cache Exception
  143           {
  144                    T re sult = nul l;
  145                    
  146                    Read ableByteCh annel meta dataReadab le = null;
  147                    Obje ctInputStr eam metada taInStream  = null;
  148                    try
  149                    {
  150                             Instan ce studyMe tadataInst ance = get WrappedCac he().getIn stance(
  151                                               getImageRe gionName() , 
  152                                               groups, 
  153                                               groupKey);
  154                             
  155                             if(stu dyMetadata Instance ! = null)
  156                             {
  157                                      metadata Readable =  studyMeta dataInstan ce.getRead ableChanne l();
  158                                      
  159                                      metadata InStream =  new Objec tInputStre am(Channel s.newInput Stream(met adataReada ble));
  160                                      
  161                                      return e xpectedRes ultClass.c ast( metad ataInStrea m.readObje ct() );
  162                             }
  163                    } 
  164                    catc h (IOExcep tion e)
  165                    {
  166                             e.prin tStackTrac e();
  167                    } 
  168                    catc h (ClassNo tFoundExce ption e)
  169                    {
  170                             e.prin tStackTrac e();
  171                    }
  172                    fina lly
  173                    {
  174                             try{if (metadataI nStream !=  null)meta dataInStre am.close() ;}
  175                             catch( Throwable  t){}
  176                    }
  177                    
  178                    retu rn result;   
  179           }
  180           
  181           pr ivate Stri ng[] creat eROIReques tGroupName (PatientId entifier p atientIden tifier)
  182           {
  183                    retu rn new Str ing [] 
  184                                      {
  185                                      VASource dCacheDeco rator.file nameOctetE scaping.es capeIllega lCharacter s("roi"),
  186                                      VASource dCacheDeco rator.file nameOctetE scaping.es capeIllega lCharacter s(patientI dentifier. toString() ),
  187                                      VASource dCacheDeco rator.file nameOctetE scaping.es capeIllega lCharacter s("metadat a") 
  188                                      };
  189           }
  190           
  191           pr ivate Stri ng createR OIRequestK ey(String  guid)
  192           {
  193                    retu rn VASourc edCacheDec orator.fil enameOctet Escaping.e scapeIlleg alCharacte rs(guid);
  194           }
  195           
  196  
  197   }

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