206. EPMO Open Source Coordination Office Redaction File Detail Report

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206.1 Files compared

# Location File Last Modified
1 IV-eHMP_CIF.zip\IMAG_Source\VISA\Java\Hi5\src\gov\va\med\imaging\hi5\client LinearWindowLevel.java Mon Dec 4 21:34:28 2017 UTC
2 IV-eHMP_CIF.zip\IMAG_Source\VISA\Java\Hi5\src\gov\va\med\imaging\hi5\client LinearWindowLevel.java Mon Dec 4 22:00:52 2017 UTC

206.2 Comparison summary

Description Between
Files 1 and 2
Text Blocks Lines
Unchanged 2 348
Changed 1 2
Inserted 0 0
Removed 0 0

206.3 Comparison options

Whitespace
Character case Differences in character case are significant
Line endings Differences in line endings (CR and LF characters) are ignored
CR/LF characters Not shown in the comparison detail

206.4 Active regular expressions

No regular expressions were active.

206.5 Comparison detail

  1   /**
  2    * 
  3    */
  4   package go v.va.med.i maging.hi5 .client;
  5  
  6   import org .apache.lo gging.log4 j.LogManag er;
  7   import org .apache.lo gging.log4 j.Logger;
  8  
  9   import com .google.gw t.canvas.d om.client. CanvasPixe lArray;
  10   import com .google.gw t.touch.cl ient.Point ;
  11  
  12   /**
  13    * @author         
BECKEC
  14    *
  15    */
  16   public cla ss LinearW indowLevel
  17   {
  18       privat e Logger l ogger = Lo gManager.g etLogger(" LinearWind owLevel");
  19       
  20       privat e final Im ageStatist ics imageS tats;
  21       privat e final Af fineTransf orm affine Transform;  
  22       privat e final Pi xelTransfo rm pixelTr ansform;
  23       privat e double l evel;
  24       privat e double w indow;
  25       
  26       public  LinearWin dowLevel(I mageStatis tics image Stats, Aff ineTransfo rm affineT ransform,  PixelTrans form pixel Transform)
  27       {
  28           th is.imageSt ats = imag eStats;
  29           th is.affineT ransform =  affineTra nsform;
  30           th is.pixelTr ansform =  pixelTrans form;
  31           
  32           th is.setLeve l(imageSta ts.getLeve l());
  33           th is.setWind ow(imageSt ats.getWin dow());
  34       }
  35       
  36       public  ImageStat istics get ImageStats ()
  37       {
  38           re turn image Stats;
  39       }
  40  
  41       public  AffineTra nsform get AffineTran sform()
  42       {
  43           re turn affin eTransform ;
  44       }
  45  
  46       public  PixelTran sform getP ixelTransf orm()
  47       {
  48           re turn pixel Transform;
  49       }
  50  
  51       public  double ge tLevel()
  52       {
  53           re turn level ;
  54       }
  55  
  56       public  void setL evel(doubl e level)
  57       {
  58           if (level < 0 .0)
  59                this.lev el = 0.0;
  60           el se if(leve l > getIma geStats(). getMaximum ())
  61                this.lev el = getIm ageStats() .getMaximu m();
  62           el se
  63                this.lev el = level ;
  64       }
  65  
  66       public  double ge tWindow()
  67       {
  68           re turn windo w;
  69       }
  70  
  71       public  void setW indow(doub le window)
  72       {
  73           if (window <  1.0)
  74                this.win dow = 1.0;
  75           el se if(wind ow > getIm ageStats() .getMaximu mWindow())
  76                this.win dow = getI mageStats( ).getMaxim umWindow() ;
  77           el se
  78                this.win dow = wind ow;
  79       }
  80       
  81       /**
  82        * 
  83        * @pa ram contex t
  84        * @pa ram width
  85        * @pa ram height
  86        * @pa ram pixelD ata
  87        */
  88       public  void load CanvasPixe lArray( in t[] pixelD ata, doubl e width, d ouble heig ht, Canvas PixelArray  cpa)
  89       { 
  90           do uble bucke tSize = ge tWindow()  / getImage Stats().ge tDisplayGr ayScaleLev els();
  91           do uble minWi ndowValue  = getLevel () - (getW indow() /  2.0);
  92           do uble maxWi ndowValue  = minWindo wValue + g etWindow() ;
  93           lo gger.info( "start loa dContext [ " + getLev el() + "-"  + getWind ow() + "]  " + bucket Size);
  94  
  95           fo r (int y =  0; y < he ight; ++y)
  96           {
  97                int rowO ffset = y  * (int)wid th;
  98                //String Builder ro wDataMsg =  new Strin gBuilder(" Row: " + y  + " ");
  99                
  100                for (int  x = 0; x  < width; + +x)
  101                {
  102                    doub le pixelVa lue = pixe lData[rowO ffset + x] ;
  103                    
  104                    int  value = 0;
  105                    if(p ixelValue  > maxWindo wValue)
  106                         value = 25 5;
  107                    else  if(pixelV alue < min WindowValu e)
  108                         value = 0;
  109                    else
  110                         value = (i nt)((pixel Value - mi nWindowVal ue) / buck etSize); 
  111                    //ro wDataMsg.a ppend(Inte ger.toHexS tring(pixe lValue) +  " ->" + In teger.toHe xString(va lue) + ",  ");
  112                    
  113                    // D o any pixe l transfor mation req uired (e.g . invert)
  114                    // P ixel trans formations  change pi xel values  but not p osition in  the image .
  115                    RGBP ixel origi nPixel = n ew RGBPixe l(value, v alue, valu e);
  116                    RGBP ixel trans formedPixe l = getPix elTransfor m().transf ormPixel(o riginPixel );
  117  
  118                    // D o the affi ne transfo rmation re quested.
  119                    // T his maps t he origin  point to t he destina tion image  point and  could inc lude
  120                    // r otation an d flipping .
  121                    Poin t originPo int = new  Point(x -  (width /2  ), y - (he ight / 2)) ;        / / the orig in is a do uble array , one doub le per pix el
  122                    Poin t destPoin t = getAff ineTransfo rm().trans formPoint( originPoin t);
  123                    int  destOffset  = getAffi neTransfor m().destin ationCPAPi xelOffset( destPoint) ;
  124  
  125                    tran sformedPix el.setValu eIn(cpa, d estOffset) ;
  126                }
  127                //logger .info(rowD ataMsg.toS tring());
  128           }
  129           lo gger.info( "stop load Context ["  + getLeve l() + "-"  + getWindo w() + "] "  + bucketS ize);
  130       }
  131  
  132       /**
  133        * 
  134        * @pa ram pixelD ata
  135        */
  136       public  static Im ageStatist ics analyz e(int widt h, int hei ght, int g rayScaleLe vels, int  displayGra yScaleLeve ls, int[]  pixelData)
  137       {
  138           in t histogra mBucketCou nt = grayS caleLevels  / display GrayScaleL evels;
  139           in t[] histog ram = new  int[histog ramBucketC ount];
  140           fo r(int inde x=0; index <histogram BucketCoun t; ++index )
  141                histogra m[index] =  0;
  142           
  143           do uble minim um = Doubl e.MAX_VALU E;
  144           do uble maxim um = Doubl e.MIN_VALU E;
  145           do uble windo w = 0.0;
  146           do uble level  = 0.0;
  147                
  148           fo r(int pixe l : pixelD ata)
  149           {
  150                if(pixel  > maximum ) maximum  = pixel;
  151                if(pixel  < minimum ) minimum  = pixel;
  152                ++histog ram[pixel  / displayG rayScaleLe vels];
  153           }
  154  
  155           St ringBuilde r sb = new  StringBui lder("Hist ogram data  [");
  156           fo r(int inde x=0; index <histogram BucketCoun t; ++index )
  157                sb.appen d( histogr am[index]  + ",");
  158           
  159           sb .append("] ");
  160           
  161           wi ndow = (ma ximum - mi nimum) / 4 ;
  162           
  163           le vel = ((ma ximum - mi nimum) / 2 ) + minimu m;
  164           
  165           Im ageStatist ics imageS tats = new  ImageStat istics(
  166                width, h eight, 
  167                grayScal eLevels, d isplayGray ScaleLevel s, 
  168                window,  level,
  169                maximum,  minimum,
  170                histogra m);
  171           
  172           re turn image Stats;
  173       }
  174       
  175   }

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