139. EPMO Open Source Coordination Office Redaction File Detail Report

Produced by Araxis Merge on 3/29/2017 4:53:31 PM Eastern Daylight Time. See www.araxis.com for information about Merge. This report uses XHTML and CSS2, and is best viewed with a modern standards-compliant browser. For optimum results when printing this report, use landscape orientation and enable printing of background images and colours in your browser.

139.1 Files compared

# Location File Last Modified
1 CTT-DM CIF Submission.zip\code\ISAAC-term-convert-rxnorm\rxnorm-ibdf\rxnorm pom.xml Fri Mar 3 16:20:47 2017 UTC
2 CTT-DM CIF Submission.zip\code\ISAAC-term-convert-rxnorm\rxnorm-ibdf\rxnorm pom.xml Wed Mar 29 18:04:03 2017 UTC

139.2 Comparison summary

Description Between
Files 1 and 2
Text Blocks Lines
Unchanged 3 1242
Changed 2 4
Inserted 0 0
Removed 0 0

139.3 Comparison options

Whitespace
Character case Differences in character case are significant
Line endings Differences in line endings (CR and LF characters) are ignored
CR/LF characters Not shown in the comparison detail

139.4 Active regular expressions

No regular expressions were active.

139.5 Comparison detail

  1   <?xml 
  2     version="1 .0" 
  3     encoding=" UTF-8"
  4   ?>
  5   <project 
  6     xmlns="htt p://maven. apache.org /POM/4.0.0
  7     xmlns:xsi= "http://ww w.w3.org/2 001/XMLSch ema-instan ce" 
  8           
  9     xsi:schema Location=" http://mav en.apache. org/POM/4. 0.0 http:/ /maven.apa che.org/xs d/maven-4. 0.0.xsd"
  10   >
  11             
  12     <modelVers ion>
  13      4.0.0
  14     </modelVer sion>
  15    
  16             
  17     <groupId>
  18      gov.vha.is aac.termin ology.conv erted
  19     </groupId>
  20             
  21     <artifactI d>
  22      rxnorm-ibd f
  23     </artifact Id>
  24             
  25     <!-- this  should be  set to ${s ourceData. version}-l oader-${lo ader.versi on} but th at doesn't  appease t he maven g ods that k now best.. ..
  26                      will  leave it  as is for  now, and i gnore the  warnings.  -->
  27             
  28     <version>
  29      ${sourceDa ta.version }-loader-$ {loader.ve rsion}
  30     </version>
  31             
  32     <packaging >
  33      pom
  34     </packagin g>
  35    
  36             
  37     <name>
  38      RxNorm to  ibdf Artif act Conver ter
  39     </name>
  40    
  41             
  42     <propertie s>
  43                       
  44      <sourceDat a.version>
  45       2016.12.05
  46      </sourceDa ta.version >
  47                       
  48      <snomed.ve rsion>
  49       20160131-l oader-3.7- SNAPSHOT
  50      </snomed.v ersion>
  51              
  52      <!-- We ne ed a snome d file to  do the con version.   This isn't  included  in the out put -->
  53                       
  54      <metadata. version>
  55       3.39-SNAPS HOT
  56      </metadata .version>
  57                       
  58      <!-- and m etadata.   This isn't  included  in the out put -->
  59                       
  60                       
  61      <loader.ve rsion>
  62       5.6-SNAPSH OT
  63      </loader.v ersion>
  64                       
  65      <!-- For n o classifi er, leave  this blank -->
  66                       
  67      <resultArt ifactClass ifier>
  68      </resultAr tifactClas sifier>
  69              
  70     </properti es>
  71             
  72             
  73     <scm>
  74                       
  75      <url>
  76       https://gi thub.com/V A-CTT/ISAA C-term-con vert-rxnor m.git
  77      </url>
  78              
  79     </scm>
  80             
  81             
  82     <licenses>
  83                       
  84      <license>
  85                                 
  86       <name>
  87        The Apache  Software  License, V ersion 2.0
  88       </name>
  89                                 
  90       <url>
  91        http://www .apache.or g/licenses /LICENSE-2 .0.txt
  92       </url>
  93                                 
  94       <distribut ion>
  95        repo
  96       </distribu tion>
  97                                 
  98       <comments>
  99        Copyright  Notice
  100                                           This is  a work of  the U.S. G overnment  and is not  subject t o copyrigh t
  101                                           protecti on in the  United Sta tes. Forei gn copyrig hts may ap ply.
  102                                  
  103       </comments >
  104                        
  105      </license>
  106                       
  107      <license>
  108                                 
  109       <name>
  110        RxNorm / U MLS licens e
  111       </name>
  112                                 
  113       <url>
  114        https://ut s.nlm.nih. gov/licens e.html
  115       </url>
  116                                 
  117       <comments>
  118        The RxNorm  content p ackaged by  this modu le is gove rned licen sed by the  National  Library of  Medicine,  Departmen t of Healt h and Huma n Services
  119       </comments >
  120                        
  121      </license>
  122              
  123     </licenses >
  124             
  125             
  126     <organizat ion>
  127                       
  128      <name>
  129       U.S. Depar tment of V eterans Af fairs
  130      </name>
  131                       
  132      <url>
  133       www. DNS    
  134      </url>
  135              
  136     </organiza tion>
  137             
  138             
  139     <developer s>
  140                       
  141      <developer >
  142                                 
  143       <propertie s>
  144                                           
  145        <info>
  146         For a list ing of dev elopers, c lone the p roject and  execute ' git shortl og -sn'
  147        </info>
  148                                  
  149       </properti es>
  150                        
  151      </develope r>
  152              
  153     </develope rs>
  154             
  155             
  156     <issueMana gement>
  157                       
  158      <system>
  159       Jazz
  160      </system>
  161                       
  162      <url>
  163       https:// DNS . DNS     /ccm/web/p rojects/CT T (CM)
  164      </url>
  165              
  166     </issueMan agement>
  167    
  168             
  169     <dependenc ies>
  170                       
  171      <dependenc y>
  172                                 
  173       <groupId>
  174        gov.vha.is aac.termin ology.conv erters
  175       </groupId>
  176                                 
  177       <artifactI d>
  178        rxnorm-moj o
  179       </artifact Id>
  180                                 
  181       <version>
  182        ${loader.v ersion}
  183       </version>
  184                                 
  185       <scope>
  186        compile
  187       </scope>
  188                                 
  189       <optional>
  190        true
  191       </optional >
  192         
  193       <!-- Not n eeded at r untime -->
  194                        
  195      </dependen cy>
  196                       
  197                       
  198      <!-- Metad ata -->
  199                       
  200      <dependenc y>
  201                                 
  202       <groupId>
  203        gov.vha.is aac.ochre. modules
  204       </groupId>
  205                                 
  206       <artifactI d>
  207        ochre-meta data
  208       </artifact Id>
  209                                 
  210       <classifie r>
  211        all
  212       </classifi er>
  213                                 
  214       <version>
  215        ${metadata .version}
  216       </version>
  217                                 
  218       <type>
  219        ibdf.zip
  220       </type>
  221                                 
  222       <optional>
  223        true
  224       </optional >
  225        
  226       <!-- Not n eeded at r untime / t ransitivel y -->
  227                        
  228      </dependen cy>
  229     
  230                       
  231      <!-- Snome d -->
  232                       
  233      <dependenc y>
  234                                 
  235       <groupId>
  236        gov.vha.is aac.termin ology.conv erted
  237       </groupId>
  238                                 
  239       <artifactI d>
  240        rf2-ibdf-s ct
  241       </artifact Id>
  242                                 
  243       <version>
  244        ${snomed.v ersion}
  245       </version>
  246                                 
  247       <type>
  248        ibdf.zip
  249       </type>
  250                                 
  251       <classifie r>
  252        Snapshot
  253       </classifi er>
  254                                 
  255       <optional>
  256        true
  257       </optional >
  258        
  259       <!-- Not n eeded at r untime / t ransitivel y -->
  260                                 
  261       <scope>
  262        compile
  263       </scope>
  264                        
  265      </dependen cy>
  266              
  267     </dependen cies>
  268    
  269             
  270     <build>
  271                       
  272      <plugins>
  273                                 
  274       <!-- Get s ource file s from arc hiva -->
  275                                 
  276       <plugin>
  277                                           
  278        <groupId>
  279         org.apache .maven.plu gins
  280        </groupId>
  281                                           
  282        <artifactI d>
  283         maven-depe ndency-plu gin
  284        </artifact Id>
  285                                           
  286        <execution s>
  287                                                    
  288         <execution >
  289                                                              
  290          <id>
  291           fetch-rxno rm-src
  292          </id>
  293                                                              
  294          <phase>
  295           generate-s ources
  296          </phase>
  297                                                              
  298          <goals>
  299                                                                        
  300           <goal>
  301            unpack
  302           </goal>
  303                                                               
  304          </goals>
  305                                                              
  306          <configura tion>
  307                                                                        
  308           <artifactI tems>
  309                                                                                  
  310            <artifactI tem>
  311                                                                                            
  312             <groupId>
  313              gov.vha.is aac.termin ology.sour ce.rxnorm
  314             </groupId>
  315                                                                                            
  316             <artifactI d>
  317              rxnorm-src -data
  318             </artifact Id>
  319                                                                                            
  320             <version>
  321              ${sourceDa ta.version }
  322             </version>
  323                                                                                            
  324             <type>
  325              zip
  326             </type>
  327                                                                                   
  328            </artifact Item>
  329                                                                         
  330           </artifact Items>
  331                                                                        
  332           <outputDir ectory>
  333            ${project. build.dire ctory}/gen erated-res ources/src
  334           </outputDi rectory>
  335                                                               
  336          </configur ation>
  337                                                     
  338         </executio n>
  339                                                    
  340         <execution >
  341                                                              
  342          <id>
  343           unpack-ibd f
  344          </id>
  345                                                              
  346          <phase>
  347           generate-s ources
  348          </phase>
  349                                                              
  350          <goals>
  351                                                                        
  352           <goal>
  353            unpack-dep endencies
  354           </goal>
  355                                                               
  356          </goals>
  357                                                              
  358          <configura tion>
  359                                                                        
  360           <includeAr tifactIds>
  361            rf2-ibdf-s ct,ochre-m etadata
  362           </includeA rtifactIds >
  363                                                                        
  364           <outputDir ectory>
  365            ${project. build.dire ctory}/gen erated-res ources/src /ibdf
  366           </outputDi rectory>
  367                                                               
  368          </configur ation>
  369                                                     
  370         </executio n>
  371                                            
  372        </executio ns>
  373                                  
  374       </plugin>
  375                                 
  376                                 
  377       <plugin>
  378                                           
  379        <!-- metad ata we wan t in the o utput pack age -->
  380                                           
  381        <groupId>
  382         org.apache .maven.plu gins
  383        </groupId>
  384                                           
  385        <artifactI d>
  386         maven-antr un-plugin
  387        </artifact Id>
  388                                           
  389        <version>
  390         1.8
  391        </version>
  392                                           
  393        <execution s>
  394                                                    
  395         <execution >
  396                                                              
  397          <id>
  398           write-pom- properties
  399          </id>
  400                                                              
  401          <phase>
  402           validate
  403          </phase>
  404                                                              
  405          <configura tion>
  406                                                                        
  407           <target>
  408                                                                                  
  409            <echoprope rties 
  410             destfile=" ${project. build.dire ctory}/pom .propertie s" 
  411            />
  412                                                                         
  413           </target>
  414                                                               
  415          </configur ation>
  416                                                              
  417          <goals>
  418                                                                        
  419           <goal>
  420            run
  421           </goal>
  422                                                               
  423          </goals>
  424                                                     
  425         </executio n>
  426                                            
  427        </executio ns>
  428                                  
  429       </plugin>
  430      
  431                                 
  432       <plugin>
  433                                           
  434        <groupId>
  435         gov.vha.is aac.termin ology.conv erters
  436        </groupId>
  437                                           
  438        <artifactI d>
  439         rxnorm-moj o
  440        </artifact Id>
  441                                           
  442        <version>
  443         ${loader.v ersion}
  444        </version>
  445                                           
  446        <execution s>
  447                                                    
  448         <execution >
  449                                                              
  450          <id>
  451           convert-rx norm-to-ib df
  452          </id>
  453                                                              
  454          <goals>
  455                                                                        
  456           <goal>
  457            convert-rx norm-to-ib df
  458           </goal>
  459                                                               
  460          </goals>
  461                                                              
  462          <configura tion>
  463                                                                        
  464           <inputFile Location>
  465            ${project. build.dire ctory}/gen erated-res ources/src /
  466           </inputFil eLocation>
  467                                                                        
  468                                                                        
  469           <!--ttyRes triction>
  470                                                                                 <ttyRe striction> IN</ttyRes triction>
  471                                                                                 <ttyRe striction> SCD</ttyRe striction>
  472                                                                                 <ttyRe striction> SCDF</ttyR estriction >
  473                                                                                 <ttyRe striction> SCDG</ttyR estriction >
  474                                                                                 <ttyRe striction> DF</ttyRes triction>
  475                                                                                 <ttyRe striction> SBD</ttyRe striction>
  476                                                                                 <ttyRe striction> BN</ttyRes triction>
  477                                                                        </tt yRestricti on-->
  478                                                                        
  479           <!--Just a n example  -->
  480                                                                        
  481           <!--annota tionSkipLi st>
  482                                                                                 <annot ationSkipL ist>SPECIE S</annotat ionSkipLis t>
  483                                                                        </an notationSk ipList-->
  484                                                               
  485          </configur ation>
  486                                                     
  487         </executio n>
  488                                            
  489        </executio ns>
  490                                  
  491       </plugin>
  492                                 
  493                                 
  494       <plugin>
  495                                           
  496        <groupId>
  497         org.apache .maven.plu gins
  498        </groupId>
  499                                           
  500        <artifactI d>
  501         maven-asse mbly-plugi n
  502        </artifact Id>
  503                                           
  504        <version>
  505         2.4
  506        </version>
  507                                           
  508        <execution s>
  509                                                    
  510         <execution >
  511                                                              
  512          <id>
  513           attach-res ult
  514          </id>
  515                                                              
  516          <phase>
  517           package
  518          </phase>
  519                                                              
  520          <goals>
  521                                                                        
  522           <goal>
  523            single
  524           </goal>
  525                                                               
  526          </goals>
  527                                                              
  528          <configura tion>
  529                                                                        
  530           <descripto rs>
  531                                                                                  
  532            <descripto r>
  533             src/assemb ly/assembl y.xml
  534            </descript or>
  535                                                                         
  536           </descript ors>
  537                                                                        
  538           <attach>
  539            false
  540           </attach>
  541                                                                        
  542           <encoding>
  543            UTF-8
  544           </encoding >
  545                                                               
  546          </configur ation>
  547                                                     
  548         </executio n>
  549                                            
  550        </executio ns>
  551                                  
  552       </plugin>
  553      
  554                                 
  555       <plugin>
  556                                           
  557        <groupId>
  558         org.codeha us.mojo
  559        </groupId>
  560                                           
  561        <artifactI d>
  562         build-help er-maven-p lugin
  563        </artifact Id>
  564                                           
  565        <version>
  566         1.9.1
  567        </version>
  568                                           
  569        <execution s>
  570                                                    
  571         <execution >
  572                                                              
  573          <id>
  574           attach-art ifact
  575          </id>
  576                                                              
  577          <goals>
  578                                                                        
  579           <goal>
  580            attach-art ifact
  581           </goal>
  582                                                               
  583          </goals>
  584                                                              
  585          <configura tion>
  586                                                                        
  587           <artifacts >
  588                                                                                  
  589            <artifact>
  590                                                                                            
  591             <type>
  592              ibdf.zip
  593             </type>
  594                                                                                            
  595             <!-- Note  that the a ssembly pl ugin doesn 't use the  same clas sifier - w e hack the  classifie r it retur ns to be a  mis
  596                                                                                                     mash of cl assifier a nd part of  type.  So  there is  always a c lassifier  on the pro duced zip  file, even  if no cla ssifier
  597                                                                                                     was specif ied by the  user.  Du ring artif act attach ment, this  classifie r/type mes s is corre cted. -->
  598                                                                                            
  599             <file>
  600              ${project. build.dire ctory}/${p roject.bui ld.finalNa me}-.ibdf. zip
  601             </file>
  602                                                                                            
  603             <classifie r>
  604              ${resultAr tifactClas sifier}
  605             </classifi er>
  606                                                                                   
  607            </artifact >
  608                                                                         
  609           </artifact s>
  610                                                               
  611          </configur ation>
  612                                                     
  613         </executio n>
  614                                            
  615        </executio ns>
  616                                  
  617       </plugin>
  618                        
  619      </plugins>
  620              
  621     </build>
  622   </project>
  623   >>>>>>> br anch 'deve lop' of ht tps://jkni az@vadev.m antech.com :4848/git/ r/ISAAC-te rm-convert -rxnorm.gi t